ZOOM Lite nesil dizileme veri haritalama ve görselleştirme yazılımıdır. Gibi Kullanıcılar giriş referans genomları ve Illumina / Solexa kısa dosyaları okur veya AB düz renk uzayı çeşitli biçimlerde dosyaları okur, * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta vb ZOOM bu kısa haritalama sonuçlarını verir referans sekans ile ilgili okur. ZOOM Lite yeni tasarlanmış çoklu aralıklı tohum kuramına dayanan hızlı ve doğru haritalama çekirdeği vardır. 240bp için 15bp işlenebilir hem tek-uçlu ve paired-end çeşitli uzunluklarda okur. Uyumsuzluklar ve okuma ve referans dizisi üzerindeki hedef bölge arasındaki çeşitli uzunluklarda bir ekleme / silme herhangi bir sayı izin verilir. Her okuma Eşsiz eşlenen sonuçlar ya da en iyi (üst N) sonuçları minimal uyumsuzlukları ve Indel uzunluğuna göre rapor edilecektir. Kalite puanları haritalama doğruluğunu geliştirmek için kullanılmaktadır. Haritalama çekirdeği dayanarak, ZOOM Lite, kullanıcıların, yerel okuma verilerini ve referans dizisi verileri yüklemek kadar dört CPU arasında paralel uygun parametreleri, işlem yüksek hacimli verileri seçin, koşu görevleri izlemek, haritalama sonuçlarını saklamanızı sağlar grafikleri görmek Ya haritalama sonuçları ve çıkış haritalama sonuçları * .Yatakta ya da daha fazla UCSC tarayıcı parça bilgileri ile ölçüm için * .GFF dosya formatları. Haritalama sonuçları okur arasına detaylı dizisi hizalamalarıyla bütün bir kromozomun üzerinde okuma derinliği grafikten, istenilen ölçekte inceledi ve referans dizisi yapılabilir. Kullanıcılar kolayca sadece bir tıklama ve sürükleme veya kaydırma yoluyla ilgi bölgelere gidin. ZOOM Lite ZOOM Studio yazılımı bir türevi olan
Bu sürümde Yeni nedir:.
Sürüm 1.5 SAM ihracat biçimi, mimari ayarlamak, daha iyi kod optimizasyonu içerir küçük Daha iyi performans için programın ikili boyutu ve yükseltilmiş dabase engining.
Yorum Bulunamadı